2009
11.04

Un grupo de 68 científicos publicarán un artículo mañana 5 de noviembre en la revista journal of heredity en el que propondrán la creación de un “zoológico genómico”. Dicho proyecto tiene como objetivo secuenciar el ADN de 10,000 especies distintas de vertebrados, lo que representa aproximadamente una secuencia por cada género de vertebrados que existe en el mundo.

El proyecto, conocido como Genome 10k project, pretende recolectar muestras de los distintos animales de zoológicos, museos, colecciones en universidades entre otras fuentes alrededor del mundo.

Los promotores originales del proyecto son: el Dr. David Haussler de la universidad de California, capus Santa Cruz (UCSC), el Dr. Stephen J. O’Brien, director del laboratorio de Diversidad Genómica del Cancer National Institute de EUA y el Dr. Oliver A. Ryder, investigador del instituto para la investigación de la conservación del zoológico de San Diego.

Aunque la idea hubiera sonado completamente disparatada hace sólo 10 años, ahora es posible pensar en proyectos de este tipo gracias a la enorme caída en los costos de secuenciación y a las novedosas tecnologías que permiten secuenciar genomas enteros en muy poco tiempo. Aunque se necesitan todavía algunos avances para hacer que el proyecto sea totalmente costeable, al ritmo que avanzan la tecnología de la secuenciación esto será posible en unos cuantos años.

Según el Dr. O’Brien, el Genome 10k project nos permitirá observar la evolución en acción a un nivel que nunca habíamos visto. Además, el proyecto proveerá de valiosa información a naturalistas, ecólogos, evolucionistas y biólogos en general, y ni qué decir de los bioinformáticos que seguramente tendrán un trabajo considerable para recolectar y organizar la información de 10,000 genomas.

Para más información, visiten la página del proyecto aquí (en inglés).

Fuente: UCSC news.

Nota importante: La imagen mostrada pertenece al autor del artículo original en UCSC news.

2009
11.02

A propósito de estas fechas en las que en México se celebra la tradricional fiesta del Día de Muertos, les traigo una canción del Rockdrigo que habla precisamente de la muerte.

Aunque no es la única canción en la que Rockdrigo González trata el tema de la muerte, sí es la única dedicada completamente a ella. En lo personal es una canción que me gusta mucho, tanto por la letra como por la música. Espero que ustedes la disfruten igual.

Rockdrigo González – Dicen que la Muerte

A continuación la letra de esta peculiar canción.

“Dicen que la muerte”. Rockdrigo González

Dicen que la muerte anda tras mis huesos,
si es así la espero
pa’ darle sus besos.
Y si no me alcanza la muy condenada
me paro un ratito
pa’ verla enojada.

Cuentan que la muerte va muy atareada,
llevándose viejos, también muchachada.
Que asusta a la gente
que asusta de veras,
pues viene y te lleva
aunque no lo quieras.

La gente le teme tal vez más que al diablo,
siente un gran castillo
cuando pobre está.
Y hasta cuentan dichos de sobrevivencia
de espíritus locos
que retan la ciencia.

Cuentan que la muerte va muy atareada,
llevándose viejos, también muchachada.
Que asusta a la gente
que asusta de veras,
pues viene y te lleva
aunque no lo quieras.

Mas hay quien no teme ni siquiera un poco,
ya sea por estar cuerdo
o por estar loco.
Y si tú te acercas a los cementerios
verás mucha gente
haciendo misterios.

Cuentan que la muerte va muy atareada,
llevándose viejos, también muchachada.
Que asusta a la gente
que asusta de veras,
pues viene y te lleva…
aunque no lo quieras.

Ya ustedes dirán si el buen Rockdrigo no tenía razón con eso de que asusta de veras, pues viene y te lleva aunque no lo quieras.
Así que antes de que me lleve, ahí les dejo la canción, para el deleite de vivos y muertos, en sus casas o en el panteón.

Nota importante: Los derechos de autor de las canciones aquí presentadas (tanto la letra como el audio) no son propiedad de este blog. Dicho material es publicado sólo con fines de difusión.

2009
10.29

El día que internet comenzó

Un día como hoy, pero de hace 40 años, se mandó el primer mensaje de una computadora a otra a través de ARPANET, la primera red que dio origen a Internet.

Interface Message Processor

Interface Message Processor. Estos aparatos del tamaño de refrigeradores eran el corazón de ARPANET, el precursor de Internet

Charley Kline, un estudiante de la universidad de Califronia en los Ángeles, escribió las letras ‘l’ y ‘o’, inicio de la palabra inglesa login, antes de que la red fallara. La primera prueba intentaba enviar un mensaje corto desde la Universidad de California al Stanford Research Institute, a 500 km. de distancia.

En ese entonces ARPANET no era más que un experimento basado en diversas teorías acerca de la conectividad de las computadoras. Es probable que en ese entonces, Kline no se imaginara que ese primer fallo marcaría el inicio de lo que hoy es la red de comunicaciones más grande que el hombre ha conocido.

En un inicio ARPANET sólo estaba diseñada para compartir datos y recursos entre centros de investigación que se encontraban lejos físicamente. Ahora es una red que conecta a millones de personas.

La historia de cómo un proyecto un tanto alocado, que se realizó básicamente a la originalidad de varios estudiantes y visionarios es realmente impresionante. Cuesta trabajo pensar que hace sólo 40 años era toda una hazaña enviar un par de palabras de una computadora a otra.

De seguir así la tendencia, quién sabe qué nos deparará el futuro y en qué se habrá convertido la Internet dentro de 40 años, claro, si el cambio climático no nos acaba primero.

Un día como hoy, pero de hace 40 años, se mandó el primer mensaje de una computadora a otra a través de ARPANET, la primera red que dio origen a Internet.
2009
10.29

Pues sí, el tiempo ha pasado y una nueva versión de ubuntu está con nosotros (si ya no puede esperar y prefiere leer este post mientras se está descargando Ubuntu, haga click aquí).

Como ya es costumbre con esta popular distribución de GNU/Linux, esta nueva versión promete ser más estable, más amigable con el usuario y tener diversas novedades para disfrutar. Entre las cosas nuevas que podremos encontrar en el “Karmic Koala” están:

  • Una nueva interfaz para el encendido y el apagado, además de un gestor de sesiones renovado. Ahora además de todas las ventajas que ya conocemos de Linux, Ubuntu se hace cada vez más atractivo visualmente
  • Se han hecho una gran cantidad de pequeñas mejoras y retoques a los íconos y la apariencia de Ubuntu.
  • Ubuntu One. Ubuntu por fin se une a la nube. Ahora con Ubuntu One puedes sincronizar datos, archivos y contactos con los servidores de Ubuntu. Cada usuario tiene 2 Gb de almacenamiento gratuitos, pero puede adquirir más si está dispuesto a pagarlo.
  • El centro de Software de Ubuntu. Antes era fácil instalar programas en Ubuntu, ahora es mucho más. Con el centro de Software de Ubuntu tendrá acceso a miles de aplicaciones libres y gratuitas con solo un click.
  • Empathy es ahora el cliente de mensajería por defecto de Ubuntu, sustituyendo a pidgin. Empathy le permitirá mantenerse en contacto con todas las redes de mensajería que se pueda imaginar: MSN, jabber, Google talk, ICQ, sólo por mencionar algunas.
  • GRUB 2 es ahora el nuevo sistema de arranque por defecto. Con muchas más opciones de personalización, GRUB 2 le permitirá al usuario usar sus propios fondos de pantalla al inicio, sólo por mencionar algunas posibilidades.
  • EXT4 se vuelve el sistema de archivos por defecto. EXT4 ofrece considerables ventajas en rendimiento comparado con EXT3. Aunque los usuarios que estén usando EXT3 o deseen seguir usándolo podrán hacerlo.
  • La versión de Ubuntu para Netbooks ha sido mejorada. Si tiene una Netbook, no dude en probar el Ubuntu Netbook Remix. Sin duda quedará sorprendido con las grandes cosas que su pequeña Netbook puede hacer si tiene el sistema operativo adecuado.

Además de los puntos ya mencionados, existen muchas otras mejoras, pero le recomiendo que pruebe esta nueva versión de ubuntu para descubrirlas. Para ver un pequeño tour de lo que Ubuntu 9.10 le ofrece haga click aquí.

Así que ahora que ya conoce las ventajas del Karmic Koala, no espere más y vaya a la página de descargas de Ubuntu.

2009
10.23

El día de hoy en una solemne ceremonia, la UNAM recibió el premio príncipe de Asturias de comunicación y humanidades 2009.

Este premio es un reconocimiento al esfuerzo y dedicación de la máxima casa de estudios, y una prueba más de que a través de la educación México puede sobresalir y superarse.

Este es un motivo de orgullo para todos los mexicanos, en especial los universitarios, y un incentivo para seguir refrendando y apoyando la enorme labor de la UNAM.

Les dejo aquí una liga para que puedan leer el discurso que pronunció el rector Narro en la entrega del premio.

Por mi raza hablará el espíritu

2009
08.17

Saludos.

Esta entrega es muy especial porque con ella inaguro el posteo de mis cuentos. De cuando en cuando iré poniendo alguno de mis cuentos para que los puedan leer y compartir. Si alguno de ustedes está interesado en leer más, visite mi página personal.

En esta primera oportunidad les dejo el primer cuento que escribí y hace poco mejoré. Es sin duda mi favorito, así que espero que lo disfruten. Sus críticas y comentarios son bienvenidos.

Las cuentas

Si tan sólo pudiera medir el fulgor de las estrellas, pensé mientras jugaba distraídamente con un lápiz. Me volteaste a ver justo en ese momento, como si hubieses notado algo inusual en mi adormecido rostro. Al ver tu cara de confusión sonreí, pero tu repentina expresión de seriedad me hizo ver que no te hacía nada de gracia. Sin decir palabra continuaste con tus cuentas. Sabía que te estaba empezando a molestar, o mejor dicho te empezaba a molestar más de lo usual. Nunca te percatabas de lo que pasaba por mi cabeza y si lo hacías nunca te interesabas en ello. Tanta concentración en el papel te distraía de todo, sin embargo los números ahí plasmados te significaban cada vez menos.

Observé tus ojos mientras saltaban de una fórmula a otra. Cada vez que los veía notaba un peculiar brillo en ellos y pensaba que debían guardar algún extraño secreto. Tomé mis notas y comencé a garabatear de manera casi frenética, dejando trazos muy marcados en el papel. Sí, definitivamente me gustaban tus ojos.

El ruido afuera era cada vez mayor, ¿o sería que adentro había cada vez más silencio? Un perro ladrando, el eterno susurro del refrigerador y el constante crick crick de los grillos. Yo escribía mis notas y tú seguías maldiciendo por lo bajo, porque las cuentas no salían.

Miles de veces te vi borrar lo que acababas de escribir, sólo para volver a llenar la hoja en unos cuantos segundos. Centenas de números rondaban por tu cabeza, como luciérnagas traviesas que aparecían y desaparecían en los sitios más oscuros de tu cerebro. Y nada, simplemente las cuentas no salían. Mientras, yo seguía con mis notas, escribiendo cada vez más rápido, aunque sin un destino que me fuera evidente en ese momento.

Definitivamente la inspiración se había ido a esconder a quién sabe qué región perdida de la galaxia, allá dónde mi mente vagaba constantemente en esos momentos, buscándola ansiosamente. Yo mis notas y tú tus cuentas.

Pasaron los minutos y mis notas cada vez eran más escuetas y comenzaban a mostrar rasgos de fastidio. La inspiración, esa vieja elusiva y burlona, se había ido a otro lado. Y aún tus cuentas parecían seguir resistiéndose.

Me levanté finalmente tras haber estado varios minutos sin escribir nada.

- “¿Y las cuentas?”, te pregunté.

- “Siguen sin salir” fue tu respuesta. Noté que ya era muy noche, así que tomé mis cosas y me dirigí a la puerta. Apenas nos despedimos, como si tuviéramos toda la vida por delante para ser más efusivos. Fue la última vez que te vi, hasta ese momento cerca de aquél café.

Debo confesar que tardé un poco en reconocerte. Tu cara era diferente, y tus ojos no brillaban más. Había pasado más de un lustro desde la última vez y mi memoria ya empañada con el tiempo tuvo que desempolvar viejos recuerdos. Aunque no lo hicieron con la rapidez que me habría gustado, las memorias llegaron vívidas, frescas y renovadas. Me estremecí un poco al reconocer mi propia vejez en tu rostro marcado por los años, sin embargo me acerqué a ti, con la firme decisión de hablarte. Al notar que dudaste un poco al verme, me percaté que debía haber cambiado tanto o más que tú. Sin embargo, aceptaste de buen grado cuando te invité a tomar algo. Platicamos un buen rato y me contaste de tu familia, tu trabajo y tus proyectos. Yo te escuchaba hablar pero era como si viera a otra persona, más vieja, más lenta, más cansada.

Las horas se fueron volando y el cielo se cubrió rápidamente con esa molesta y espesa oscuridad, típica de las noches sin luna. Me dijiste que tenías que irte y nos despedimos como si nos hubiéramos visto todos los días. Estabas abriendo la puerta, a punto de desaparecer, cuando vino a mis labios la pregunta:

- “¿Y las cuentas?”. Te paraste en seco al escuchar mis palabras. Poco a poco tus ojos renacieron de nuevo, y brillaron en la penumbra. No podía ver tu rostro con claridad, pero casi podría jurar que sonreíste, como si esa sola pregunta hubiera hecho retroceder el tiempo hasta aquella última vez.

- “No salieron”, me respondiste con una voz tan nostálgica como familiar, mientras te perdías en el frío de la noche…

Espero que l@s que llegaron hasta acá, hayan disfrutado del cuento. Para obtener la versión pdf del mismo, hagan click aquí

Nota importante: Los cuentos están liberados bajo una licencia creative commons de Atribución-No comercial-No derivadas 3.0 o superior.

2009
08.14
Un par de perseidas atraviesan una oscura noche de verano. Foto: Adolfo Plasencia

Un par de perseidas atraviesan una oscura noche de verano. Foto: Adolfo Plasencia

Tal vez hayas oído hablar de las perseidas, también conocidas como lágrimas de San Lorenzo, la maravillosa lluvia de estrellas que ocurre cada verano en el hemisferio norte. Incluso es posible que hayas tenido la oportunidad de ver este hermoso espectáculo. Las perseidas nos visitan de manera regular cada año y representan uno de los eventos astronómicos más sorprendentes que se puede observar, tanto por su duración como por su cantidad.

Este año, la noche con más actividad fue la pasada madrugada del miércoles 12 de agosto, aunque las perseidas surcan los cielos veraniegos por más de seis semanas.

Pero ¿de dónde vienen las Perseidas? En primer lugar, es un fenómeno muy antiguo y existe evidencia de que han sido observadas al menos desde hace 2000 años. Se llaman así porque parecen surgir de la constelación de Perseo. También son conocidas como lágrimas de San Lorenzo porque usualmente su pico de máxima actividad coincide con el festejo del martirio de dicho santo.

Las Perseidas se generan del cometa 109P/Swift-Tuttle. Son fragmentos congelados de diversos tamaños que orbitan al cometa y son atraídos por la gravedad de la tierra; al entrar a la atmósfera se desintegran, dejando tras de sí una estela luminosa muchas veces visible a simple vista.

Aunque las Perseidas no son la lluvia de estrellas más intensa, en sus momentos de máxima actvidad pueden llegar a caer hasta 60 meteoros por hora, varios de los cuales son visibles sin necesidad de ningún instumento. Por supuesto, es buena idea alejarse de las luces de la ciudad para poder observarlas en todo su esplendor, pero incluso si vivimos en una ciudad grande y contaminada, podremos ver algunas de las más brillantes desde el patio de nuestra casa.

Así que ha llegado el momento de las Perseidas. El único problema es que con tantas estrellas fugaces, uno ya no sabe ni qué desear.

Fuentes: Nasa News, Wikipedia.

2009
08.01

En esta entrega les traigo esta maravillosa canción del buen Rockdrigo González. “Acerca de ti, acerca de mí” es la octava pista del álbum “Aventuras en el DeFe” y es una de las pocas canciones serias de amor que llegó a “publicar”. La letra y los acordes están llenos de la nostalgia de un amor pasado, pero nunca olvidado. Les invito a escucharla y disfrutarla. Hagan click en el link de abajo para oír o descargar la canción.

Rockdrigo González – Acerca de ti, acerca de mí

Para los despistados y los que no quisieron o no pudieron escuchar el audio, aquí les dejo la letra:

“Acerca de ti, acerca de mí”. Rockdrigo González

Por ese algo que no está
hoy me pongo a cantar, hoy me pongo a pensar.
Aunque se que a veces no es bueno recordar,
que las cosas pasadas no han de regresar
y que todas las cosas que hicimos
son parte del viento y del tiempo así nada más,
acerca de ti, acerca de mí.

Uno pasa por la vida
sintiéndose bien o sintiéndose mal.
Algunas veces te quedas, algunas veces te vas
pero el amor verdadero, ese no lo olvidarás,
aunque todas las cosas que hicimos
son parte del viento y del tiempo así nada más.

Acerca de ti, acerca de mí
yo voy a construir una canción
para así darle forma a un viejo amor.

Uno pasa por la vida
sintiendose bien o sintiendose mal.
Algunas veces te quedas, algunas veces te vas
pero el amor verdadero, ese no lo olvidarás,
aunque todas las cosas que pasen
sean parte del viento y del tiempo así nada más

Acerca de ti, acerca de mí,
yo voy a construir una canción
para así darle forma a un viejo amor.

Eso es todo por el momento, esperen la siguiente entrega de este maravilloso autor.

Nota importante: Los derechos de autor de las canciones aquí presentadas (tanto la letra como el audio) no son propiedad de este blog. Dicho material es publicado sólo con fines de difusión.

2009
07.29
Se generaron ratones saludables a partir de Células iPS

Se generaron ratones saludables a partir de Células iPS. Foto: Rama

Una experimento impactante que habla de lo promisorias que son las Células Madre Pluripotentes Inducidas (células iPS por sus siglas en Inglés) se publicó hace unos días en la revista Science. Dos grupos independientes lograron generar ratones aparentemente saludables a partir de Células iPS, lo que sugiere fuertemente que son pluripotentes.

Las células madre embrionarias (Células ES por sus siglas en inglés) son muy apreciadas por los científicos por su capacidad de generar prácticamente cualquier tipo celular del linaje embrionario. Sus posibles aplicaciones médicas son innumerables, pero su uso ha sido controversial debido a que son obtenidas de embriones tempranos, que finalmente son destruidos en el proceso. Varios países han prohibido la obtención de Células ES humanas debido a los problemas éticos que presentan la manipulación y destrucción de embriones humanos.

En 2006, un par de grupos de investigación reportaron una metodología a través de la cual pudieron generar células con características muy similares a las ES a partir de fibroblastos de ratón. A dichas células se les bautizó con el nombre de “Células Madre Ploripotenciales Inducidas” o Células iPS. Un año después la metodología fue aplicada exitosamente a células humanas. A pesar del enorme avance que representó esta investigación en el campo de las células madre, todavía estaba por verse si las Células iPS eran capaces de comportarse de manera similar a las ES, especialmente en la característica de la pluripotencia (es decir, la capacidad para generar cualquier tipo de linaje celular embrionario).

Un experimento común para probar la capacidad de pluripotencia de ciertas células consiste en inyectarlas en un embrión que tiene el doble de cromosomas. El embrión por sí mismo sólo puede generar placenta, pero si las células inyectadas son realmente pluripotentes, se podrá generar un feto viable.

Dicho experimento ya había sido realizado, sin éxito, usando Células iPS. Sin embargo, dos grupos de China reportaron hace unos días en las revistas Science y Cell Stem Cell que fueron capaces de generar ratones aparentemente saludables usando Células iPS. Ambos grupos tuvieron tasas de éxito muy similares a las obtenidas cuando se usan Células ES (de alrededor del 3%).

Estos resultados muestran que, al menos en ratón, las Células iPS tienen capacidades funcionales similares a las Células ES. A pesar de que esta es una importante prueba a favor de las Células iPS, todavía queda por investigar de manera más fina las posibles diferencias y similitudes entre células iPS y células ES.

Es poco probable que el experimento se repita con células humanas debido a los conflictos éticos que generaría, por lo que las investigaciones tendrán que continuar por bastante tiempo antes de que las Células iPS puedan ser tomadas en cuenta como una verdadera opción terapeútica.

2009
07.26

Con una tremenda goleada, la selección mexicana se impuso a su homónima estadounidense con un marcador de 5-0 en la final de la copa oro 2009. Con esta victoria, “la verde” acumula un total de 5 triunfos en dicho torneo, superando a EUA que tiene 4.

Debido a la inconsistente (y muchas veces penosa) actuación que tuvieron los seleccionados mexicanos durante la copa oro, hay que tomar con reservas este resultado. A pesar del triunfo tan contundente que tuvo la selección, no hay que olvidar que el cuadro que presentó EUA es alternativo y no será igual de fácil el partido de eliminatoria rumbo al mundial de Sudáfrica.  Sin embargo, es indudable que el título es bien recibido y servirá para dar confianza tanto a jugadores como aficionados.

Sólo el tiempo dirá si este triunfo es el inicio de muchos o fue sólo un chispazo momentáneo.